Le accuse contro Librizzi sono molto pesanti, concussione e violenza sessuale pluriaggravata. L'arresto, nel giugno 2014, da parte degli agenti della sezione di polizia giudiziaria del Corpo forestale delle Stato, ha creato forte disagio nel mondo della solidarietà trapanese. Le indagini, coordinate dal sostituto procuratore di Trapani Paolo Di Sciuva, raccontano di un prete privo di scrupoli che facilitava l'iter di concessione dello status di rifugiato agli immigrati a fronte di prestazioni sessuali.
L'arresto di don Sergio Librizzi ha portato “nello sgomento, nell'amarezza e nel desiderio di vivere ancora più coerentemente alla luce della Verità” – dichiaravano con una nota lo scorso 24 giugno dalla curia trapanese. Il Vescovo all'epoca lo ha immediatamente sospeso dalla sua funzione di parroco.
Librizzi, membro influente della commissione territoriale di Trapani per il riconoscimento della protezione internazionale, deve rispondere per otto casi di violenza commessi a partire dal 2009. Nell'inchiesta è finita anche la gestione di Librizzi della cooperativa diocesana Badiagrande, che negli ultimi anni ha gestito diversi centri di accoglienza come il CIE di Milo ed il CARA, Centro di Accoglienza per richiedenti Asilo, di Salinagrande.